一、天庭神仙体系
在《西游记》的神仙体系中，天界拥有至高无上的地位，汇聚了来自道教和佛教的诸多神仙。其中，天仙占据着主导地位，以玉皇大帝为首，统领三界。
玉皇大帝居于天界最高宫殿——凌霄宝殿，掌管天庭一切事务。在凌霄殿外，有通明殿，是众仙觐见玉皇大帝的地方。通明殿内文臣有邱弘济、张道陵、葛先翁和许旌阳四位天师，武将则有天蓬元帅、天佑元帅、佑圣真君和翊圣真君，合称北极四圣或通明殿四圣。
天庭核心成员还有三清：玉清元始天尊、上清灵宝天尊和太清道德天尊，即太上老君。太上老君居住在兜率宫，在三十三天之上；元始天尊则居于上清天弥罗宫。
与玉皇大帝地位并列的有四帝（四御）和王母娘娘。四帝分别是东华大帝、南极仙翁、北极紫薇大帝和勾陈大帝，而王母娘娘为天庭之母。
太乙天仙在《西游记》中数量众多，其中包括五炁真君（岁星木德星君、火德星君、太白金德星君、水德星君和土德星君）、五斗星君（东西南北东斗）、三官（天地水）、九曜真君（太阳星君、太阴星君等）、托塔李天王、哪吒、二十八宿、十二元辰、五方揭谛、四值功曹、六丁六甲和五岳四渎等。天庭各宫殿内众多的仙吏，如七仙女、嫦娥和太上老君的守炉道人等，也是受封天仙。尽管孙悟空身列天仙，但他属于太乙散数，未入真流。
二、人界神仙体系
《西游记》中人界神仙体系相对薄弱，仅有一位西牛贺洲万寿山五庄观的镇元子，尊称与世同君。
三、佛界神仙体系
五方五老是佛派神仙体系中的核心人物，包括西天佛老、菩萨、圣僧和罗汉。他们居住在灵山大雷音寺。其中，观音菩萨坐镇普陀山落伽崖；崇恩圣帝则居住在瀛洲。南赡部洲也有佛派神仙，如乌巢禅师、地藏王菩萨和大圣国师王菩萨。
四、其他神仙体系
鬼仙主要活跃于幽冥界，包括土地、山神和城隍等。
仙界之间存在着相互转化关系。天仙犯错可被贬为妖仙。如天蓬元帅调戏嫦娥后被贬为猪八戒；卷帘大将打碎玻璃盏后被贬为沙僧。太上老君的守炉道人因失职被贬为土地，成为鬼仙。