【实验目的】
(1)掌握T载体连接法在PCR产物直接克隆中的应用原理。
(2)熟练应用T载体连接法,实现PCR产物的有效直接克隆。
【实验原理】在DNA的合成过程中,Taq聚合酶会在PCR产物的3’末端添加一个非模板依赖的A。T载体则是一种带有3’T突出端的载体,其两端可以在连接酶的作用下与PCR产物两端的A进行A-T配对,从而将PCR产物插入T载体的多克隆位点中,形成含有目标片段的重组载体。常用的T载体如pUCm-T和pMD19-T等,都是经过特别设计的载体,以便于对PCR产物进行高效克隆。例如,pUCm-T载体具备蓝白筛选的特性,使得通过lacZ缺陷型宿主细胞的转化筛选过程更为简便。这些载体还提供了M13引物位点,便于后续的DNA测序操作。
【实验材料、试剂及设备】
1. 实验材料:经过回收的PCR扩增DN段、T载体。
2. 实验试剂:
(1)T4连接酶。
(2)10×T4连接酶缓冲液。
(3)无菌水。
3. 实验设备:生化培养箱、制冰机、冰盒、0.5mL无菌离心管、移液器、吸头、台式低速离心机等。
【实验步骤】
步骤一:在冰上准备一个0.5mL的离心管,加入以下反应物(总体积20μL):PCR回收产物10μL,T载体1μL,10×T4连接酶缓冲液2μL,以及T4连接酶1μL。补充无菌水至总体积20μL。
步骤二:将混合物轻轻弹动离心管底部以混匀,然后以3000r/min的速度短暂离心。
步骤三:将离心管置于16℃的环境中,连接2至4小时。
【实验注意事项】
(1)反应温度的把控非常关键,过高的温度可能黏性末端间的氢键稳定性,而温度过低则可能影响连接酶的活性。
(2)在使用Tip头吸取酶液时,要确保操作准确,避免Tip头外部沾有过多的酶液。
(3)T4DNA连接酶对温度敏感,因此在冰上长时间放置可能影响其稳定性,建议在使用前从冰箱中取出,使用后立即放回。
【实验讨论与问题】
问题:是否可以直接对PCR产物进行连接反应?
回答:虽然PCR产物含有进行克隆所需的序列信息,但通常需要先进行回收纯化。这是因为PCR产物中可能含有杂质DN段、残存引物等,这些杂质可能会影响TA克隆的效率。通常需要先对PCR产物进行纯化处理,再将其与T载体进行连接反应。