芦丁（Rutin），又称为芸香（rutoside）、维生素P（VP）、皮素-3-O-香糖昔（querin-3-O-rutinside 03R），是一种在植物界中广泛分布的黄酮类天然有机化合物。其造价低廉，可应用于临床治疗，且副作用少，是较好的天然物源。
PDI及抑制剂与血栓形成的示意关系。为了深入研究Rutin与PDI的相互作用及其在血栓形成中的角色，我们进行了详细的结构分析和实验研究。
前期研究表明，Rutin能够选择性结合PDI蛋白，有效抑制其活性。通过核磁共振技术，我们发现Rutin与PDI的结合区域主要在PD的b linker上。关于Rutin与PDI的具体相互作用机理目前尚不明确。
核磁共振技术和等温量热滴定法被用来检测PDI与Rutin的结合强弱。实验结果显示，PDI与Rutin的相互作用是强结合，且化学计量比为1:1。这为后续设计向PDI的新型抗血栓等抑制剂奠定了基础。
在实验中，我们使用液体核磁共振波谱分析法研究PDI与Rutin相互作用的实验。通过采集一系列实验数据，我们得到了PDI与Rutin复合物的分子间NOE，并进一步得到了PDI b'x8及PDI-c与Rutin的复合物结构模型。
为了更准确地显示PDI bxa与Rutin的相互作用模式，我们采集了分子间NOE数据。结合已有的PDI-c的晶体结构，我们计算得到了PDI bxa结合Rutin的复合物结构模型。该模型显示，Rutin分子中的疏水环与PDI bxa的疏水空腔形成典型的疏水堆积作用。
目前对于PDI及其抑制剂的研究很多，发现了许多效果良好的抑制剂。对于PDI-抑制剂复合物结构的研究却相对较少。我们的研究不仅填补了这一空白，而且为进一步理解PDI如何通过其疏水空腔结合底物提供了新的见解。
尽管由于PDI bxa分子量限制等问题，我们无法采集并归属得到更多的蛋白质分子内NOE信息，但我们的研究仍为后续使用其他手段解析PDI及抑制剂的复合物结构提供了方向。
我们的研究为理解PDI与Rutin的相互作用及其在血栓形成中的角色提供了重要的实验依据和理论支持。
参考文献
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