在前文中，我们曾提及小遥凭借“攻略”的方式获得了她的妙蛙种子。而在宝可梦的世界里，小智同样拥有一只妙蛙种子。按常理推测，小智的妙蛙种子应该已经进化到了较高的等级，或许是妙蛙花，或许是妙蛙草。由于妙蛙种子本身的抗拒进化特性，小智的妙蛙种子依然保持着原状。当小遥成功收服妙蛙种子后，这无疑为小智的妙蛙种子与小遥的妙蛙种子创造了和谐共处的契机。接下来的剧情，依然围绕着这两只妙蛙种子的故事展开，让我们一同来探索发生了什么。
注：本段为个人解读，如有误，欢迎指正。
相关集数：超世代第74集《双妙蛙种子，夺回精灵球》
被调换的精灵球事件：
在这一集中，小遥的妙蛙种子来到了繁华的城市，对周围的一切都充满了好奇。当它到达宝可梦中心时，小智一行人决定让小智的妙蛙种子与小遥的妙蛙种子相互熟悉。三人组假扮成宝可梦传送装置的维修人员，导致从大木博士那里传送过来的精灵球是假的。真正的精灵球却通过另一个传送口落入了三人组的手中。
两只妙蛙种子的邂逅：
由于异常的传送口，小智一行人找到了三人组。在阻止他们的过程中，小智的妙蛙种子回到了小智一行人的身边。两只妙蛙种子意外相遇，但其他大部分的精灵球仍被三人组拿走。小智一行人决定继续追踪，在这个过程中，小智的妙蛙种子展现出优秀的领导能力，教导小遥那活泼的妙蛙种子。最终，通过询问野生草系宝可梦以及傲骨燕、凤蝶的帮助，小智一行人成功找到了三人组。
两只妙蛙种子的合作：
实际上，三人组的被抓获也源于他们的疏忽大意。其中，小次郎的一个袋子破裂，使得小智一行人得以持续追踪。随后，利用妙蛙种子的藤鞭技能，他们成功夺回了一部分精灵球。而其余的精灵球，则是通过两只妙蛙种子的默契合作取回。它们互相帮助，施展双重攻击，最终因小智的妙蛙种子不能久留研究所而传送回去。
以上便是本集的主要内容与解析。整体而言，这一集作为过渡篇章，主要讲述了两只妙蛙种子的故事。